目前已证实,至少有两种病原微生物参与非淋菌性尿道炎的发病,即沙眼衣原体和解脲支原体。也发现其他一些微生物与非淋菌性尿道炎有关。非淋菌性尿道炎亦可能由一些非性传播的病因导致。
细菌性尿道炎可以继发于上泌尿道感染、细菌性前列腺炎、尿道狭窄、包茎及尿道插管等。此外,先天性畸形、化学性刺激、肿瘤和某些过敏因素也可导致尿道炎。全身性疾病如Stevens-Johnson综合征可能会引起尿道炎。还没有证据表明手淫、饮用咖啡、酗酒、某些食物、性行为过少或过频会引起尿道炎。
人类由沙眼衣原体所致疾病,古人即已发现。首次从生殖道分离到衣原体则是在1959年,Jones、Collier和Smith,他们从一位新生儿眼炎婴儿之母的子宫颈发现沙眼衣原体。1964年,第1次从与结膜炎有流行病学关系的男子尿道中发现衣原体。沙眼衣原体是NGU最常见的病原体,其次是支原体、阴道毛滴虫、白色念珠菌和单纯疱疹病毒等。
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